基因型大数据系统
基因型大数据系统(简称基因型系统)为百奥云旗下的首款基因型管理系统,后台采用大数据集群架构设计,有效提高系统的高可用性和稳定性。可以支持储存和管理海量(PB级别)标记和基因型数据,并整合了各类分析可视化工具进行深度挖掘。
产品特色
更海量
基于大数据集群分布式储存,支持海量数据储存和管理。
更便捷
整合公共库资源,可以有效的进行品种比较。
更专业
整合各类基因型分析工具(多品种比较、相似性比较、遗传距离分析、进化树、群体结构分析、PCA分析等)。
更前沿
系统整合全基因组预测模块,可以结合[育种表型数据系统]进行更专业的模型预测,让品种从"海选"到"甄选"。(内部测试)
功能特色
基因型数据分析模块内置常用的基因型分析工具,如遗传距离分析、聚类分析、群体结构分析、PCA 分析,基因型比较等等,用户只要点击几下鼠标就可以轻松完成专业的生物信息分析工作,辅之以可视化图形展示,一目了然。
海量数据管理
系统支持海量标记和基因型数据管理。
全库比较,1vs1或1vs多比较
为便于用户寻找数据库中与目标材料基因型最接近的材料,同时支持全库比较。
遗传距离、PCA
遗传距离计算,群体结构分析, PCA分析,是最常见的分析内容,它们的应用十分广泛,能够帮助我们解决某些生物学问题。
遗传距离分析
进化树在生物学中,用来表示物种或材料之间的进化关系。用树状图或扇形图展示育种材料亲缘关系的远近,是育种科研工作者常用的手段。
ADMIXTURE分析
支持可以可视化的群体结构分析。